指能水解RNA磷酸二酯键的酶称核糖核酸酶(ribonuclease，RNase)，不同的RNase其专一性不同。核糖核酸酶，白色粉末，为具有球蛋白性状的一种蛋白质。溶于水、50%丙酮。此酶最适宜温度为60℃，85℃以上失去作用，最适宜的pH值为7.6。是催化核糖核酸水解的一种核酸内切酶，可使胞嘧啶核酸解聚，对胸腺核酸则无作用。
核糖核酸酶的分类
1.核糖核酸酶A(RNase A)：来源于牛胰脏，是一种内切核糖核酸酶，可特异攻击RNA上嘧啶残基的3'端，切割胞嘧啶或尿嘧啶与相邻核苷酸形成的磷酸二酯键，反应终产物是3'嘧啶核苷酸和末端带3'嘧啶核苷酸的寡核苷酸。无辅助因子及二价阳离子存在时，核糖核酸酶A的作用可以被胎盘RNA酶抑制剂(RNasin)或氧钒一核糖核苷复合物(vanadyl-ribonuclosidecomplex，VRC)所抑制。
2.核糖核酸酶T1(RNase T1)：来源于米曲霉(Aspergillus orjzae)，它特异地作用于鸟嘌呤3'端磷酸，切割位点在鸟嘌呤的3'磷酸和相邻核苷酸的5'羟基之问的磷酸二酯键，反应终产物为3'鸟苷酸和末端带3'鸟苷酸的寡核苷酸片段。
3.核糖核酸酶H(RNase H)：最早是从小牛胸腺组织中发现的，其编码基因已被克隆到大肠杆菌中。它能特异地降解DNA:RNA杂交双链中的RNA链，产生具有3'一OH和5'一磷酸末端的寡核苷酸和单核苷酸，它不能降解单链或双链的DNA或RNA。
核糖核酸酶的作用
核糖核酸酶能催化核糖核酸(RNA)的降解，现已能人工合成。药用油膏局部外用于治疗外伤及关节疼痛。据报道，核糖核酸酶能改变宿主细胞新陈代谢，抑制病毒合成，在体外能抑制流感病毒增殖，在鸡胚内能抑制痘苗、疱疹病毒形成。临床用核糖核酸酶每天肌注180毫克，对治疗流行性脑炎有益。